近日,我室抗旱节水研究及应用创新团队李君教授在中科院一区Top期刊International Journal of Biological Macromolecules(IF=8.2)发表了题为“Prime editing: Its systematic optimization and current applications in disease treatment and agricultural breeding”的综述文章。
该综述全面系统性地介绍了目前最新CRISPR/Cas9介导的基因编辑工具—引导编辑。引导编辑(prime editing)采用一种结合Cas9切刻酶[nCas9(H840A)]和逆转录酶(M-MLV RT)的融合蛋白,并使用一条可编程的引导编辑向导RNA (pegRNA)。通过逆转录的过程,引导编辑能够精确地将所需的编辑信息从pegRNA导入到基因组的目标位点。因此,引导编辑可以实现所有12种类型的碱基替换、DNA片段的靶向插入和删除、大片段DNA的整合与倒置,甚至以上编辑类型的组合等。
然而,由于引导编辑机制的复杂性,其编辑的效率普遍较低,这限制了其更广泛的应用。因此,研究人员们采用了多种策略来优化引导编辑,来提高其编辑效率。这些策略包括改造逆转酶、使用不同的nCas9变体或同源物、操纵DNA修复途径、合理设计pegRNA、优化引导编辑载体结构等。
此外,该综述还介绍了一种双pegRNA的策略,它通过在靶位点DNA的正义链和反义链上引入相同的编辑,进一步提高了引导编辑的效率,同时扩大了基因组的可编辑类型,包括大片段DNA的插入、删除、整合、倒置以及复制等。
最后,该综述还总结了目前引导编辑在多种疾病治疗和农业育种上的应用,并对引导编辑目前面临的挑战以及未来的发展方向进行了展望。
余潇潇、霍贯中硕士为该论文的共同第一作者,李君教授为该论文的通讯作者。本科生于金泰和李慧园参与完成了该项工作。该项工作得到了河北省重点研发计划、河北省优秀青年科学基金等项目的资助。
文章链接:https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2023.127025