报告内容:DAP-seq技术在生物学研究中的应用
报告时间:2023年11月09日(星期四)下午15:00-17:00
报告人:赵瑞 副教授
报告地点:河北农业大学西校区农科楼二楼报告厅(263)
报告人简介:
赵瑞,博士,副教授,2011年博士毕业于中国农业大学生物学院细胞生物学专业,同年受聘于北京林业大学生物科学与技术学院,2019年受聘于北京林业大学林木分子设计育种高精尖创新中心,任青年研究员。已在The Plant Cell,New Phytologist,Plant Physiology,Journal of Experimental Botany等国际知名植物学期刊发表论文30余篇。主持国家自然科学基金青年项目、北京市自然科学基金面上项目。围绕林木相关优良性状,进行林木抗逆分子信号通路的研究,发现并鉴定了一批重要功能蛋白,通过调节eATP水平和囊泡转运参与植物对逆境的胁迫响应;通过SOS信号途径、脱落酸信号转导过程调控盐胁迫下杨树的离子平衡与活性氧平衡。
报告摘要:
在基因功能组学和表观遗传学研究中,转录因子结位点(Transcription Factor Binding Sites,TFBS)的发掘一直是研究热点。传统的 ChiP-seg (染色质免共沉淀测序)方法,在抗体质量很好的情况下能够有效检测到 TFBS。然而,好的抗体可遇不可求,这限制了ChIP-seq 更广泛的应用,DAP-seq技术的出现,使TFBS 的研究不再局限于物种,不再受抗体质量的限制,为生命科学领域转录因子的研究提供了新的有效工具。